Por que o bloco do menu sobrepõe parte da primeira tela?

Consulte as configurações de posicionamento do menu (Configurações do bloco → Configurações principais → Comportamento da posição do menu).

Se a opção "Fixed on scroll" for selecionada, o menu se sobreporá ao primeiro bloco em qualquer caso. Você pode resolver esse problema adicionando um preenchimento extra igual à altura do menu no início da página. Você pode usar o bloco DV05 para fazer isso.   

Em vez do bloco DV05, você também pode definir o preenchimento superior nas configurações do primeiro bloco.